据多家台媒报道，6月17日，有金马地区民众目击到数架大陆民航飞机从金门、马祖本岛上空飞过。由于飞机的样子在地面上用肉眼就能清晰可见，所以引发了一定程度的恐慌，有台媒就直呼“傻眼”，称这种飞越“不正常，太离谱”。
当天晚些时候，“台空军”和“金防部”都做出回应称，当天共有58架次大陆民航机为了雷雨而偏航绕飞，其中15架次飞越金门上空，8架次飞越马祖上空，事先都有通报台湾的航管部门。这些飞机的飞行高度在7300米到1万2千米之间，没有进入金门和马祖的所谓“终端管制区域”，“台军”也按照规定对这些飞机进行了鉴别和监控。
不过大部分岛内民众对此并不买账。有人就称，坏天气经常有，但这样的“飞越领空”却是前所未见，民进党当局的借口太假了。还有人认为，民航飞机的飞行高度并非是民进党当局宣称的7300米以上，这其实就是大陆对赖清德的“台独”言行的一种反制措施。
